Tagasi põhilehele

Genoomika ja transkriptoomika andmed

Vaata ka: Juhendid kuidas genoomika ja transkriptoomika andmeid jagada | Teenused: genoomika ja transkriptoomika

Avalikud andmed

Andmed Euroopa COVID-19 Andmeportaalis

COVID-19 puhanguga seotud toor- ja assambleeritud SARS-CoV-2 järjestused, sealhulgas haiguspuhangu isolaadid ja koronaviiruse bioloogiaga seotud kirjed:


KoroGeno-EST viiruse genoomi sekveneerimine

KoroGeno-EST uuringu eesmärgiks on sekveneerida (määrata genoomi koostis) ja analüüsida Eestis nakkusi põhjustanud ja põhjustavat SARS-CoV-2 täisgenoome ning viia neile läbi molekulaar-epidemioloogiline analüüs. KoroGeno-EST uuring toimub Tartu Ülikooli, Terviseameti ja SYNLAB Eesti OÜ koostöös. Siin on ära toodud uuringu peamised tulemused SARS-CoV-2 klaadide ja muret tekitavate variantide osakaalude kohta, mida saab külastaja ajas jälgida. Selleks saab:


KoroGeno-EST uuringus raames teevad koostööd:

Rahastatakse Euroopa Liidu COVID-19 pandeemiale reageerimise raames


   

Peamiste Nextstraini klaadide, WHO poolt kasutatavate nimetuste ja Pango liinide omavahelised vastavused ning skemaatilised evolutsioonilised seosed
19A (B)20A (B.1)19B (A)20B (B.1.1)21A (Delta, B.1.617.2)20C21H (Mu, B.1.621)21D (Eta, B.1.525)21B (Kappa, B.1.617.1)20E (EU1, B.1.177)21M (Omicron, B.1.1.529)21E (Theta, P.3)20J (Gamma, V3, P.1)20I (Alpha, V1, B.1.1.7)20F (D.2)20D (B.1.1.1)21I (Delta)21J (Delta)21F (Iota, B.1.526)21C (Epsilon, B.1.427/429)20H (Beta, V2, B.1.351)20G (B.1.2)21L (Omicron, ~BA.2)21K (Omicron, BA.1)21G (Lambda, C.37)22A (Omicron, BA.4)22B (Omicron, BA.5)22C (Omicron, BA.2.12.1)22D (Omicron, BA.2.75)22F (Omicron, XBB)22E (Omicron, BQ.1)
Phylogenetic relationships of Nextstrain SARS-CoV-2 clades (source ). Please credit/link to Nextstrain if using this figure.







Andmeid uuendatakse kord nädalas.

/2022-12-07/